morphLineDetection

Projeto MorphLineDetection

O projeto MorphLineDetection "Detecção de formas elípticas em imagens usando Morfologia Matemática" é uma implementação em Python e C do projeto de mestrado "Detecção de ovos de S. Mansoni apartir da detecção de seus contornos". Para maiores detalhes, imagens e vídeos segue o link do projeto: http://www.ime.usp.br/~edelgado/projeto.php

Requerimentos:

Para solicitar a bibliotéca SDC Morphology Toolbox for Python precisa-se seguir os seguintes passos:

solicitar uma licença
executar o script "~~/morph4python16/morphinstall", e logo abrir a página "~~/morph4python16/register.html"
preencher os campos e submeter o formulário
você receverá um e-mail com a licença "pymorph_license.txt"
copiar e colar a licença "pymorph_license.txt" na pasta "~/morph4python16/"

Configurações:

Precisa-se definir diretórios específicos devido a configurações em variáveis de ambiente e criação de links simbólicos.

Por exemplo colocar os scripts Python em /home/user/myDownloadedSoftware/ O pacote MMorph em /home/user/software/morph4python16/

As seguintes configurações devem ser realizadas:

Incluir a licença do pacote MMorph na variável de ambiente PATH.
```
export PATH = $PATH:/home/user/software/morph4python16
```
Criar a variável de ambiente LD_LIBRARY_PATH, para que o computador encontre as bibliotecas compartilhadas do software e do pacote MMorph (.so).
```
export LD_LIBRARY_PATH = $LD_LIBRARY_PATH:/home/user/software/morph4python16:/home/user/myDownloadedSoftware
```

Execução dos scripts:

A través da GUI

Para executar pela Interface gráfica, usa-se o script projeto.py.

python projeto.py

A través dum terminal

Executar o script respectivo de cada processo. Por exemplo, num terminal deve escrever:

Para suavizado da imagem:

python processoSuavizado.py '/home/user/folderWithImages/' '/home/user/folderWithImagesResult/' 8 60 30

Para aplicar o filtro de Ordem:

python processoFiltroDeOrdem.py '/home/user/folderWithImages/' '/home/user/folderWithImagesResult/' 6 1 10

Para detecção de linhas:

python processoDeteccaoDeContornos.py '/home/user/folderWithImages/' '/home/user/folderWithImagesResult/' 6 70 1 500

Para detecção de elipses:

python processoDeteccaoDeElipses.py '/home/user/folderWithImages' '/home/user/folderWithImagesResult' 150 0.1 150 0.3 500 50 0.95

Observação: Os parâmetros são de exemplo, eles estão fortemente relacionados às características própias de cada tipo de imagens.

Autores

Edwin Delgado Huaynalaya edelgado@ime.usp.br
Robert Ainsley McLaughlin robert.mclaughlin@uwa.edu.au
Nina T. S. Hirata nina@ime.usp.br